Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsc2P55292 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsc2P55292 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms