Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fdft1P53798 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms