Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms