Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbtP53395 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbtP53395 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbtP53395 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbtP53395 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DbtP53395 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DbtP53395 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DbtP53395 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbtP53395 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DbtP53395 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms