Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna1P52793 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna1P52793 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna1P52793 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms