Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec1P51908 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms