Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RoraP51448 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RoraP51448 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RoraP51448 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RoraP51448 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RoraP51448 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RoraP51448 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RoraP51448 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RoraP51448 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RoraP51448 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RoraP51448 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RoraP51448 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RoraP51448 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RoraP51448 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms