Protein–RNA interactions for Protein: P50992

Atp4b, Potassium-transporting ATPase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4bP50992 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp4bP50992 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp4bP50992 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms