Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa8P50706 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa8P50706 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa8P50706 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa8P50706 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa8P50706 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms