Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FmodP50608 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FmodP50608 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FmodP50608 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FmodP50608 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FmodP50608 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FmodP50608 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FmodP50608 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FmodP50608 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FmodP50608 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FmodP50608 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FmodP50608 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FmodP50608 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms