Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbrP50284 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LtbrP50284 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms