Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd7P50283 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms