Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cav1P49817 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cav1P49817 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cav1P49817 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms