Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms