Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl29P47915 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms