Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf4P43488 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms