Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms