Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd1P40201 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd1P40201 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chd1P40201 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd1P40201 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd1P40201 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd1P40201 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd1P40201 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd1P40201 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms