Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms