Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Col18a1P39061 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms