Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtlP38585 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TtlP38585 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TtlP38585 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TtlP38585 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TtlP38585 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TtlP38585 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TtlP38585 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TtlP38585 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TtlP38585 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtlP38585 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtlP38585 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtlP38585 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms