Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpargP37238 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpargP37238 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpargP37238 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpargP37238 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpargP37238 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpargP37238 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpargP37238 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpargP37238 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpargP37238 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PpargP37238 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PpargP37238 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpargP37238 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpargP37238 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms