Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddit3P35639 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms