Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms