Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms