Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh15P33146 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms