Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms