Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VtnP29788 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VtnP29788 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VtnP29788 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VtnP29788 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VtnP29788 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VtnP29788 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VtnP29788 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VtnP29788 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VtnP29788 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VtnP29788 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VtnP29788 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VtnP29788 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VtnP29788 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VtnP29788 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VtnP29788 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VtnP29788 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VtnP29788 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VtnP29788 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VtnP29788 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VtnP29788 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VtnP29788 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VtnP29788 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VtnP29788 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VtnP29788 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VtnP29788 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VtnP29788 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VtnP29788 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VtnP29788 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VtnP29788 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms