Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OatP29758 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
OatP29758 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OatP29758 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
OatP29758 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OatP29758 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OatP29758 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OatP29758 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OatP29758 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OatP29758 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OatP29758 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OatP29758 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OatP29758 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OatP29758 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OatP29758 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OatP29758 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OatP29758 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OatP29758 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OatP29758 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms