Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Hoxd10P28359 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Hoxd10P28359 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Hoxd10P28359 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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