Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apex1P28352 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apex1P28352 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms