Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb1P28230 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms