Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms