Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnd1P25322 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms