Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NdnP25233 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NdnP25233 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdnP25233 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NdnP25233 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NdnP25233 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NdnP25233 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdnP25233 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NdnP25233 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdnP25233 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdnP25233 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdnP25233 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NdnP25233 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms