Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxd11P23813 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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