Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms