Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja1P23242 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja1P23242 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gja1P23242 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms