Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3aP23116 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms