Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfaP20033 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PdgfaP20033 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms