Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl13aP19253 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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