Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms