Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms