Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms