Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptbp1P17225 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms