Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms