Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp53P15975 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp53P15975 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms