Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd2P13011 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms