Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl1P12850 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms