Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms